三國時代に生きる一人の軍師として、諸葛亮や周瑜といった名だたる軍師たちに挑戦する三国志12withパワーアップキット(PK)の新モード。彼らとの戦闘に見事勝利すれば、呂布や関羽といった武将を仲間に加え、より強力な編成を組み上げることができます。自らの分身となる軍師を育て、多くの武将たちとの絆を深めながら、すべての戦場の制覇を目指します。
＊軍師制覇モードは「パワーアップキット(PK)」版のコンテンツとなりますのでご注意ください。
徐庶や荀彧をはじめとする軍師たちが、三国志の有名戦闘を舞台に、プレイヤーの前に立ちはだかります。戦闘に勝利し、用意された特殊な条件を達成すれば、より強力な武将を仲間に加えることができます。
プレイヤーの行動により発生する様々なイベントが、戦闘の流れを大きく変化させます。状況の変化に即座に対応し、自軍を勝利に導く采配が求められます。
・ステージごとに違いますが、基本的には自軍が攻撃側であれば、敵本陣陥落か、敵軍全滅。自軍が守備側であれば、カウント全消化か敵本陣陥落か、敵軍全滅となります。
・軍師としてステージが終わるたびに内容に応じて、育成ポイントを獲得できます。育成ポイントで軍師である自分の能力や秘策などを向上・習得することができます。
・一緒に戦う武将を獲得できます。1ステージ勝つたびに10枚のカードを取得できます。（同じ武将カードが何回も出ることはありません）全部で578人の武将を獲得できます。中でも特別な武将は、各ステージの条件をクリアしなければ獲得できません。
三国志12パワーアップキットの「軍師制覇」は全15ステージから構成されます。
No,01：博望坡の戦い | 軍師制覇
No,02：兗州の戦い | 軍師制覇
No,03：虎牢関の戦い | 軍師制覇
No,04：合肥の戦い | 軍師制覇
No,05：樊城の戦い | 軍師制覇
No,06：官渡の戦い | 軍師制覇
No,07：雒城の戦い | 軍師制覇
No,08：南中の戦い | 軍師制覇
No,09：夷陵の戦い | 軍師制覇
No,10：潼関の戦い | 軍師制覇
No,11：徐州の戦い | 軍師制覇
No,12：江東の戦い | 軍師制覇
No,13：街亭の戦い | 軍師制覇
No,14：漢中の戦い | 軍師制覇
No,15：古の戦い | 軍師制覇
一般的な武将を獲得するには、ステージ達成終了後に、武将カードを10枚もらえるためそこで獲得できます。ステージ終了後に、登用選択の画面で4つのカード「東の青龍」「南の朱雀」「西の白虎」「北の玄武」を提示されるので1枚選びます。
そうするとその選んだカードに基づいて10枚の武将カードがもらえます。レアカードなどの表記もありますが、2度同じカードが出ることはありません。よって何度もステージクリアをしていけば基本的には通常の武将は全部揃えられる仕様になっています。
一方でそれだけでは獲得できない特殊な武将も一部います。関羽や呂布、孔明などの優秀な武将が対象になります。彼らは、ステージごとに設定された条件をクリアした上で、ステージ達成をしなければ仲間になりません。また仲間になったとしてもさらに対象の「絆」ステータスを達成しないと実戦で利用できません。
ステージごとの一部の貴重な各武将の獲得条件を達成してステージクリアして、武将カードを獲得しても、それだけでは手に入りません。下記の「絆」条件の達成がないと実際一部の貴重な武将を実戦で活用することができません。「絆」は育成ポイントを貯めて、軍師武将の能力を向上、特技習得、などを達成すると獲得できるようになっています。以下が「絆」の発動条件になります。
| 絆名 | 統率 | 武力 | 知力 | 政治 | 特技 | 利用可能武将 |
| 桃園の誓い | 90 | 80 | 80 | ー | ー | 劉備,張飛,関羽 |
| 乱世の奸雄 | 90 | ー | 80 | 80 | ー | 曹操,許褚,典韋 |
| 小覇王 | 90 | 70 | ー | 80 | ー | 孫策,周瑜,太史慈 |
| 天下無双 | 90 | 90 | ー | ー | ー | 呂布,貂蝉 |
| 蜀五虎将 | 85 | 80 | ー | ー | 豪傑 | 趙雲,馬超,黄忠 |
| 魏四天王 | 85 | 75 | ー | ー | 一騎 | 夏侯惇,夏侯淵,曹仁,曹洪 |
| 紫髭公 | 85 | ー | ー | 80 | 練兵 | 孫権,周泰,甘寧,徐盛,丁奉 |
| 武の信奉者 | 85 | 85 | ー | ー | ー | 張遼,陳宮,高順 |
| 伏龍鳳雛 | 80 | ー | 85 | ー | 鬼謀 | 諸葛亮,龐統 |
| 晋の系譜 | 80 | ー | ー | 80 | ー | 司馬懿,司馬師,司馬昭 |
| 魏五将軍 | 80 | 80 | ー | ー | 攻城 | 徐晃,張郃,于禁,楽進 |
| 孫呉大都督 | 80 | ー | 80 | ー | 水練 | 陸遜,呂蒙,魯粛 |
| 南蛮の炎 | 80 | 85 | ー | ー | ー | 孟獲,祝融,兀突骨 |
| 異民族の強者 | 80 | ー | ー | ー | 収集,弁舌 | 蹋頓,徹里吉,越吉,雅丹,丘力居 |
| 遺志を継ぐ者 | 75 | ー | 75 | ー | 補修 | 姜維,魏延,馬岱 |
| 江東の虎 | 75 | 75 | ー | ー | 遠射 | 孫堅,黄蓋,韓当,程普 |
| 曹魏の頭脳 | 75 | ー | 80 | ー | 神速 | 郭嘉,荀彧,荀攸,程昱 |
| 魏文の名将 | 75 | ー | ー | 75 | 商才 | 曹丕,鄧艾,郭准,郝昭 |
| 巨悪 | 75 | 75 | ー | ー | 名士 | 董卓,李儒,華雄 |
| 袁家の旗 | 75 | ー | ー | 75 | 兵器 | 袁紹,文醜,顔良,田豊,沮授 |
| 漢の古将 | 70 | ー | ー | ー | 人脈,兵心 | 朱儁,皇甫嵩,盧植 |
| 反骨の軍師 | 70 | ー | 75 | ー | 冷静 | 賈詡,法正,徐庶 |
| 晋呉の友情 | 70 | ー | ー | 70 | ー | 陸抗,羊祜 |
| 北の烈風 | 70 | 70 | ー | ー | 監視 | 馬騰,龐徳,韓遂,公孫瓚 |
| 黄天当立 | 70 | ー | ー | ー | 耕作 | 張角,張宝,張梁 |
「能力」を上げていく必要があるのですが、まずは上記特別な武将の獲得にも基本的には必要な「統率」を上げていくと良いと思います。それと同時に下記の記載の「特技」を早めに取得させて、戦争自体を有利に運べるようになりましょう。
| 特技名 | 特技取得必要ポイント |
| 商才 | 2,000 |
| 耕作 | 2,000 |
| 名士 | 2,600 |
| 兵心 | 3,000 |
| 練兵 | 3,000 |
| 収集 | 1,600 |
| 人脈 | 2,600 |
| 監視 | 1,400 |
| 補修 | 1,400 |
| 弁舌 | 1,800 |
| 豪傑 | 5,000 |
| 一騎 | 3,000 |
| 神速 | 4,000 |
| 水連 | 2,400 |
| 遠射 | 2,000 |
| 攻城 | 4,000 |
| 兵器 | 3,000 |
| 冷静 | 2,600 |
| 鬼謀 | 30,000 |
※特技の説明一覧は下記リンクをご参考
・特技一覧 | 三國志12攻略
○担当サイド：攻撃側
○初期固定部隊
○援軍部隊
○秘策：鼓舞の舞、空城の策、捕縛の策、連環の策
○担当サイド：攻撃側
○初期固定部隊
○援軍部隊
○秘策：鼓舞の舞、偽報の策、采配の策、穴攻の策
○担当サイド：攻撃側
○初期固定部隊
○援軍部隊
○秘策：鼓舞の舞、帰陣の策、連環の策、援兵の策